Épidémiologie moléculaire reliant les clusters multihospitaliers de Pneumonie Pneumocystis jirovecii opportuniste

À l’éditeur-Pneumocystis jirovecii est responsable de la pneumonie inflammatoire sévère chez les receveurs de greffe Nous avons rencontré un groupe de pneumonie fulminante P jirovecii PJP chez les receveurs de greffe se produisant un nombre d’années SD, années après transplantation, au-delà de notre triméthoprime-sulfaméthoxazole Période de prophylaxie -SMZ Des clusters supplémentaires ont émergé dans d’autres hôpitaux de Sydney n = patients, hôpitaux régionaux n =, grandes unités de transplantation interjuridictionnelles n =, et autres hôpitaux interétatiques n = au cours des années, éventuellement contrôlés par réintroduction de la prophylaxie TMP-SMZ universelle pendant des mois Huit autres patients ont présenté des hôpitaux après l’arrêt de la prophylaxie à long terme, qui a été repris après des mois sans maladie. Au total, les infections à PJP ont eu lieu dans le rein n =, foie n =, foie-rein n =, et rein-pancréas n = receveurs de greffe et patients atteints de lupus et patients hématologiques dans les hôpitaux; Des typages de séquences multilocus de régions variables connues dans le génome de P jirovecii ont été entrepris pour définir l’épidémiologie moléculaire de l’épidémie Nous avons évalué les séquences concaténées de loci génétique β-tub, DHPS, mtLSU et ITS / provenant de patients atteints de PJP et de témoins non apparentés; Des relations phylogénétiques ont été établies en utilisant le logiciel PAUP * b Sinauer Associates, Sunderland, Massachusetts L’analyse génétique des séquences d’ADN a révélé un type de séquence de génotype initial, et des génotypes étroitement apparentés ne différant que par un polymorphisme mononucléotidique dans le mtLSU ST ou ITS / ST région, alors que les séquences β-tub et DHPS étaient identiques Le dernier génotype identifié, apparu plusieurs mois après le cas-index, différait par des nucléotides. Le dépistage des contacts méticuleux a révélé une colocalisation des patients PJP prodromiques asymptomatiques dans nos salles d’attente et la transmission interhospitalière La transmission du patient au patient par des gouttelettes aéroportées explique le mieux l’épidémiologie, soutenue par des preuves de traçage moléculaire et des antécédents d’exposition individuels. Une source environnementale commune est improbable compte tenu de multiples clusters distincts dans des zones géographiques disparates. l L’épidémiologie des PJP opportunistes précoces dans la transplantation d’organes moderne a été fondamentalement modifiée par la prophylaxie TMP-SMZ de routine, avec des présentations maintenant de plus en plus tard ou dans des grappes d’établissements de santé [,,,, ], dont la reconnaissance est souvent obscurcie par de longues périodes d’incubation [,,] et la présentation sporadique de cas sporadiques individuels. La PJP opportuniste à l’ère moderne est mieux conceptualisée comme une maladie clinique survenant chez plusieurs hôtes sensibles, émergeant de sous-populations immunodéprimées qui se sont colonisées. Il est intéressant de noter que même les souches «témoins» P jirovecii, méthodologiquement incluses pour démontrer la dissimilarité avec les souches épidémiques, étaient elles-mêmes interdépendantes. Ces échantillons provenaient du virus de l’immunodéficience humaine infecté par le VIH, d’oncologie ou d’immunosuppression. La vulnérabilité d’un individu à la colonisation respiratoire et à l’infection subséquente est influencée par toute maladie pulmonaire et sa réponse immunitaire à l’agent pathogène déterminée par l’immunosuppression de greffe, une infection antérieure par le cytomégalovirus, Ainsi, la PJP contemporaine représente probablement un problème de santé publique, plutôt que l’explication traditionnelle de la réactivation de la colonisation latente par une immunité réduite. Nous suggérons le génotypage centralisé de tous les isolats pour identifier les groupes permettre des contre-mesures préventives appropriées

Remarques

Remerciements Nous remercions nos collègues médecins et infirmières de transplantation pour des informations et des échantillons d’ADN Conflits d’intérêts potentiels Tous les auteurs: Aucun conflit signaléTous les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits d’intérêts potentiels Conflits que les éditeurs considèrent pertinents pour le contenu du manuscrit divulgué